Massively parallel signature sequencing (MPSS)

La prima delle tecnologie di sequenziamento ad alto rendimento, sequenziamento di firme massicciamente parallelo (o MPSS), è stata sviluppata negli anni '90 presso Lynx Therapeutics, una società fondata nel 1992 da Sydney Brenner e Sam Eletr. MPSS era un'operazione basata su complex biglie che utilizzava un complex per la legatura dell'adattatore seguita dalla decodifica dell'adattatore, leggendo la concatenazione in incrementi di quattro nucleotidi. Questa operazione lo ha reso suscettibile a bias specifico della sequenza o perdita di sequenze specifiche. Sulla base del fatto che la tecnologia era così complex, l'MPSS è stato eseguito solo "internamente" da Lynx Therapeutics e non DNA le macchine di sequenziamento sono state vendute a laboratori indipendenti. Lynx Therapeutics si è fusa con Solexa (successivamente acquisita da Illumina) nel 2004, portando allo sviluppo del sequencing-by-synthesis, un più semplice a portata di mano acquisito da Manteia Predictive Medicine, che ha reso MPSS obsoleto. In ogni caso, le proprietà essenziali dell'output MPSS erano tipiche dei successivi tipi di dati ad alto rendimento, comprese centinaia di migliaia di brevi sequenze DNA. Nel caso di MPSS, questi sono stati solitamente utilizzati per il sequenziamento del cDNA per misurazioni della forma genica dei livelli di espressione.

Immagine 151A | Le analisi di concatenazione multiple e frammentate devono essere assemblate sulla base delle loro aree di sovrapposizione. | Suspencewl / CC0 | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Mapping_Reads.png) da Wikimedia Commons

Immagine 151A | Le analisi di concatenazione multiple e frammentate devono essere assemblate sulla base delle loro aree di sovrapposizione. | Suspencewl / CC0 | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Mapping_Reads.png) da Wikimedia Commons

Author : Milos Pawlowski

References:

Molecular Biology Techniques I

Techniques of Molecular Biology II

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