Rilevamento di giunzioni alternative

Un layout di matrice di giunzione esone utilizza sonde specifiche per i siti di giunzione previsti o potenziali degli esoni previsti per un gene. È di densità intermedia, o copertura, a una tipica forma genica di array di espressione (con 1-3 sonde per gene) e un array di piastrellatura genomica (con centinaia o migliaia di sonde per gene). Viene utilizzato per analizzare la forma di espressione di forme di giunzione alternative di un gene. Gli array di esoni hanno un layout diverso, impiegando sonde progettate per incontrare ogni singolo esone per geni noti o previsti e possono essere utilizzati per rilevare isoforme di splicing unalike.

Microarray di geni di fusione

Un gene Fusion microarray può incontrare trascritti di fusione, ad esempio da campioni di cancro. Il principio alla base di questo si microarrays basa sulla giunzione alternativa microarrays. La strategia di layout oligo consente misurazioni combinate di giunzioni trascritte chimeric con misurazioni esone di singoli partner di fusione.

Immagine 146A | Due chip Affymetrix. In basso a sinistra viene mostrata una corrispondenza per il confronto delle dimensioni. | Nessun autore leggibile dalla macchina fornito. Supponeva Schutz (in base alle rivendicazioni sul copyright). / CC BY-SA (http://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/legalcode) | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Affymetrix-microarray.jpg) da Wikimedia Commons

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Author : Milos Pawlowski

References:

Molecular Biology Techniques I

Techniques of Molecular Biology II

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