Software per bioinformatica e design

L'uso dei plasmidi come tecnica in biologia molecolare è supportato da software di bioinformatica. Questi programmi registrano la concatenazione DNA dei vettori plasmidici, aiutano a prevedere i siti di taglio degli enzimi di limitazione e a pianificare le manipolazioni. Esempi di pacchetti software che gestiscono mappe plasmidiche sono ApE, Clone Manager, GeneConstructionKit, Geneious, Genome Compiler, LabGenius, Lasergene, MacVector, pDraw32, Serial Cloner, VectorFriends, Vector NTI e WebDSV. Questi pezzi di software aiutano a condurre interi esperimenti in silico prima di fare esperimenti sul bagnato.

Collezioni di plasmidi

Molti plasmidi sono stati creati nel corso degli anni ei ricercatori hanno distribuito plasmidi a database di plasmidi, ad esempio le organizzazioni non profit Addgene e BCCM / LMBP. È possibile identificare e sollecitare i plasmidi da questi database per la ricerca. I ricercatori inoltre spesso caricano sequenze di plasmidi nel database NCBI, da cui è possibile recuperare sequenze di plasmidi specifici.

Immagine 239A | Una rappresentazione schematica del vettore pBR322 con i siti di limitazione indicati in blu. | Ayacop (+ Yikrazuul) / Public domain | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:PBR322.svg) from Wikimedia Commons

Immagine 239A | Una rappresentazione schematica del vettore pBR322 con i siti di limitazione indicati in blu. | Ayacop (+ Yikrazuul) / Public domain | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:PBR322.svg) from Wikimedia Commons

Author : Milos Pawlowski

References:

Molecular Biology Techniques II

Techniques of Molecular Biology V

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