Gli approcci sperimentali per determinare la costituzione degli acidi nucleici, ad esempio RNA e DNA, possono essere abitualmente classificati in metodi biofisici e biochimici. I metodi biofisici utilizzano le proprietà fisiche fondamentali delle molecole per la determinazione della costituzione, inclusa la cristallografia a raggi X, NMR e la crio-EM. I metodi biochimici sfruttano le proprietà chimiche degli acidi nucleici utilizzando reagenti e condizioni specifici per testare la costituzione degli acidi nucleici. Tali metodi possono comportare sondaggi chimici con reagenti specifici o fare affidamento su una chimica nativa o analogica. Approcci sperimentali distinti hanno meriti unici e sono adatti a scopi sperimentali distinti.
Metodi biofisici
Cristallografia a raggi X.
La cristallografia a raggi X non è comune per i soli acidi nucleici, poiché né DNA né RNA formano facilmente cristalli. Ciò è dovuto al maggior grado di malattia intrinseca e dinamismo nelle strutture degli acidi nucleici e alle spine dorsali di ribosio-fosfato caricate negativamente (desossi), che si respingono a vicenda nelle immediate vicinanze. In conclusione, gli acidi nucleici cristallizzati tendono ad essere complessati con una proteina di interesse per fornire una regolazione strutturale e neutralizzare la carica negativa.
Immagine 225A | blotting Configurazione del sistema capillare blotting per il trasferimento di RNA da un gel electrophoresis a una membrana blotting. | RNA405 / Public domain | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Capillary_blot_setup.svg) from Wikimedia Commons
Author : Milos Pawlowski
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